कंद फसलों के लिए पौध संरक्षण प्रौद्योगिकियों का विकास इस विभाजन का जनादेश है। कंद फसलों को प्रभावित करने वाले विभिन्न रोगों और कीटों पर अनुसंधान प्रमुख गतिविधि है। विभिन्न कीट और रोगों से प्रभावित क्षेत्रों के विभाजन और तरीकों समस्याओं को हल करने के विशेषज्ञों द्वारा दौरा कर रहे हैं की सिफारिश की और किसानों के लाभ के लिए प्रदर्शन कर रहे हैं। कसावा मोज़ेक रोग जैसे महत्वपूर्ण वायरल रोगों के प्रबंधन के लिए जैव प्रौद्योगिकी के दृष्टिकोण यहां पर एक प्रमुख शोध कार्यों में से एक है। विभाजन ने कसावा के पत्तों से बायोपेस्टीसाइड विकसित किए थे और यह बहुत ही मामूली दर से किसानों को बेचा जा रहा है।

कासावा आधारित बायोपेस्टीसाइड्स को पपीता मीली बग, एफ़ीड्स, बोरर कीटों जैसे लाल हथेली की भुजाओं और भंडारण कीट जैसे सीटोफिलस ऑरिझा, राइजोपत्ता डोमिनिका के खिलाफ विकसित किया गया है। जैव कीटनाशक के उत्पादन के लिए पायलट प्लांट संस्थान में स्थापित किया गया है।

फसल चक्र अध्ययनों से यह पता चला कि शक्कर कंदी में धान - शक्कर कंदी-लोबिया प्रणाली से धुन नुकसान को कम कर सकता है। मुख्य घटक के रूप में सिंथेटिक सेक्स फेरोमोन वाला एक बहुत ही प्रभावी आईपीएम पैकेज मीट आलू भुजा के नियंत्रण के लिए 9 राज्यों में सफलतापूर्वक प्रदर्शित किया गया है। इसके अलावा एक कैरोमोन , बोहेमरील एसीटेट, शक्कर कंदी के पेरिडरम में मौजूद, अपने नियंत्रण में वादा करता है कि दोनों नर और मादाओं को आकर्षित किया जाता है।

प्राकृतिक दुश्मनों की पहचान कंद की फसल कीटनाशियों के लिए की गई थी स्कोलोथ्रीप्स इंडसस और कोकिनिनिड शिकारी, मकड़ी के कण पर, एकरसिया एसपीपी और एरेटोमोसेरस एसपीपी पर व्हील्थ पर। बीमिसिया टॅबासी के जीवों ने पहली बार पहचान की है। तमिलनाडु के कसावा इलाकों में सफेदफ़्लुआ प्रहार का गंभीर कारण पाया गया था, जहां पर इसका औद्योगिक महत्व है।

ईपीएन के शेल्फ लाइफ को बढ़ाने के लिए एक प्रक्रिया विकसित की गई है और एक ईपीएन फॉर्मूलेशन का मानकीकरण किया गया है जो चींटियों, लाल चींटियों और उनके साथ जुड़ी मीली कीड़े और घरों, खेतों और लॉन में और आसपास पाए जाने वाले दीमक के खिलाफ प्रभावी है। पेटेंट "एंटीओपोथाजेनिक नेमेटोड पर एंट्स और दीमक के प्रभावी बायोकंट्रोल और मार्केटिंग के लिए उनका भंडारण और पैकिंग" पर दायर किया।

कवक के खिलाफ प्रभावी ईपीएन से अलग बैक्टीरिया मेटामॉलाइट से तीन बायोएक्टिव अणु (फ्यूसरियम ऑक्सीस्पोरम और राइज़ोक्टोनिया सोलानी) को शुद्ध, पहचान और उनकी संरचना को स्पष्ट किया गया। ये मानव रोगजनक बैक्टीरिया और कवक के खिलाफ भी प्रभावी हैं। नौवीं बायोएक्टिव अणुओं को अलग किया गया और शुद्ध किया गया। पेटेंटिंग के लिए चार पंजीकृत किए गए हैं।